Appleが、サポート情報「iOS 9 と OS X El Capitan で新しくなるメモ」を公開し、新しくなったメモについて、いくつかの注意点を案内しています。

アップグレードする前に HTML フォーマットをメモにコピーして貼り付けると、アップグレード後は見た目が変わり、同じ HTML フォーマットではなくなるそうです。

また、アップグレードしたメモは IMAP をサポートせず、Microsoft Outlook に接続できないそうで、Windowsからメモを編集するには、iCloud メモにアクセスする必要はあるそうです。