東京大学 情報基盤センターが、Apple Keyboard (テンキー付き - JIS)のUSBポートにLightning - USBケーブルを接続すると、抜けなくなくなる事象が複数発生しているとして禁止すると案内しています。

今後キーボードの下部、左右にある USBポートに封印を施す予定だそうです。

また、ECCS 端末のその他の USB ポートでも抜けなくなるという報告があるそうで、他社製 Lightning ケーブルを使用するよう推奨しています。

なお、Appleに対して問い合わせたところ、抜けなくなった場合の対応方法は無いと回答したそうです。