iPhone FAN（仮）の「アップルのiPhoneのページに「アイホン」へのリンクが。」によると、アップルが、iPhone 3Gの製品情報に「iPhone商標は、アイホン株式会社のライセンスに基づき使用されています。」とした追記を行ってるそうです。

アイホン株式会社とAppleは、日本国内においてはアイホン社がApple 社に使用許諾を、日本以外の地域においては両社の商標が共存することで合意しており、それに基づく処置だと思われます。